国内刊号:32-1442/R
国际刊号:1007-4368
发布日期:
作者:蒋 祝,孙 洁,蒋 涛,朱 猛,李志华,程 越,陈梦茜,戴俊程,沈 冲,胡志斌
单位:南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,
关键词:冠心病;易感位点;靶向测序;中国人群
基金:国家自然科学基金重大项目(81390543);江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015A067);江苏高校优势学科建设工程资助项目
目的:全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWASs)已发现了多个冠心病(coronary heart disease,CHD)易感区域。然而,这些易感区域内的致病基因和真正致病位点尚不清楚。本研究旨在通过对报道的易感区域进行靶向测序来鉴定CHD相关基因和变异。方法:基于GWAS Catalog数据库筛选满足GWAS显著水平的CHD易感位点,经过多个数据库评估和基因功能检索,系统筛选了19个CHD易感区域内的关键基因。针对上述易感基因,在192例中国人群冠心病患者和192例健康对照中进行捕获测序。通过Logistic回归和计数法评估常见、罕见变异与CHD发生之间的关联。对于鉴定的CHD相关变异,采用功能注释和表达数量性状(eQTL)分析来评估其潜在的生物学功能。结果:5个常见变异关联P值<0.05,功能注释表明其中rs12970与心血管组织中APOA1表达增加显著相关。鉴定了3个功能性罕见变异:WDR35 rs139543775、KLHDC10 rs60941031、CTSH rs3129。结论:通过在GWAS报道的区域中进行精细定位研究,为CHD遗传研究提供了新线索,但是仍需进一步大样本研究和功能实验来验证。
来源:2019年第5期
《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部