南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2019年第6期:人FAT1基因启动子的克隆鉴定及其功能浅析

发布日期:

作者:乔春敏,乔笑芹,周国平

单位:南京医科大学第一附属医院儿科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院儿科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院儿科,江苏 南京 210029,

关键词:脂肪非典型钙黏蛋白1;启动子;转录调控

基金:江苏省“科教强卫”工程创新团队(领军人才)项目(CXTDA2017018)

目的:克隆人脂肪非典型钙黏蛋白1(FAT atypical cadherin 1,FAT1)基因启动子,找到核心启动子区域并对其转录调控机制进行初步分析。方法:通过PCR方法获得人FAT1基因5′上游1 163 bp(-1 029~+134 bp)的片段,亚克隆至pGL3-basic载体;通过步移缺失构建不同缺失片段的重组质粒。双荧光素酶报告活性分析检测各重组质粒在A549细胞和HEK293T细胞中的活性,找到核心启动子区域。利用生物信息学方法预测核心区域的转录因子结合位点。结果:经测序、酶切鉴定,成功构建了人FAT1启动子荧光素酶活性报告基因重组质粒。与pGL3-basic质粒相比,人FAT1启动子重组质粒的相对荧光素酶活性增加(P < 0.05)。通过生物信息学软件预测人FAT1启动子区域(-233~-110 bp)可能含有TFAP2C、KLF5等转录因子结合位点。结论:成功构建人FAT1启动子不同缺失片段的荧光素酶报告基因重组质粒。通过荧光素酶活性比较,推测人FAT1的核心启动子区域位于-233~+134 bp区域,其中可能含有若干转录因子结合位点。

来源:2019年第6期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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