南京医科大学学报(自然科学版)

作者：张秀青,于春琳,刘 峰,赵德育

单位：南京医科大学附属儿童医院呼吸科，江苏 南京 210008,,南京医科大学附属儿童医院呼吸科，江苏 南京 210008,,南京医科大学附属儿童医院呼吸科，江苏 南京 210008,,南京医科大学附属儿童医院呼吸科，江苏 南京 210008,

关键词：PDE4D;哮喘;GEO;GWAS;肥大细胞

基金：江苏省青年医学人才项目（QNRC2016087）；南京市科委（社发）（201723003）；南京市卫计委重点项目（ZKX18041）

目的：筛选哮喘相关候选基因，并在人群和动物水平验证。方法：从高通量基因表达数据库（gene expression omnibus，GEO）搜索哮喘痰相关基因芯片数据，利用GEO 2R筛选表达差异基因，并参考全基因关联分析（genome-wide association study，GWAS）筛选哮喘相关基因，收集哮喘患儿及同期健康儿童痰标本，构建小鼠哮喘模型、大鼠肥大细胞株（RBL-2H3）哮喘模型，应用RT-PCR进行验证。结果：共纳入2套哮喘痰基因芯片数据，选出有交集的差异表达基因190个，结合GWAS最终筛选出哮喘相关基因磷酸二酯酶4D（PDE4D）。进一步验证PDE4D在哮喘患儿痰样本中表达上调（P < 0.05），但在哮喘小鼠模型整个肺组织中表达下调（P < 0.05），而在致敏的RBL-2H3细胞中表达上调（P < 0.05）。结论：PDE4D在人群、哮喘小鼠及肥大细胞中存在差异表达，可能作为肥大细胞参与哮喘发展的研究靶点。

来源：2019年第11期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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