南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2020年第1期:人短链TSLP启动子区的克隆鉴定及功能分析

发布日期:

作者:何 佳,曹 倩,周国平

单位:南京医科大学第一附属医院儿科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院儿科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院儿科,江苏 南京 210029,

关键词:胸腺基质淋巴生成素;启动子;转录调控

基金:国家自然科学基金(81970579)

目的:构建人短链胸腺基质淋巴生成素(short isoform thymic stromal lymphopoietin,sfTSLP)启动子全长及其长度不等片段的萤光素酶报告质粒,以确定启动子活性区域并预测功能性转录因子结合位点。方法:使用按基因组序列设计的引物,通过PCR分离人sfTSLP启动子片段,并将之插入萤光素酶报告基因载体pGL3-basic中。通过步移缺失构建其截短片段,通过双萤光素酶报告基因系统测定所有启动子缺失克隆在HEK-293细胞中的活性,并使用生物信息学手段预测其潜在的转录结合位点。结果:经菌液PCR、双酶切、测序,成功构建了人sfTSLP启动子及其截短片段萤光素酶报告质粒,并确定其启动子活性区域位于5′侧翼区-200~+25 nt区域内,且可能含有SP1/SP3、SPI1/SPIB、TCF3、ETS1等转录因子结合位点。结论:首次对人sfTSLP启动子区进行了研究,初步确定了其启动子活性区域及可能的转录因子结合位点,为更进一步的研究指明了方向。

来源:2020年第1期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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