南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2020年第6期:基于TCGA数据库分析ITGA5 mRNA在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其预后价值

发布日期:

作者:张舒婷,刁鹏飞,金致纯,严 斌,王 林

单位:南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室,南京医科大学附属口腔医院正畸科,江苏 南京 210029,,南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室,南京医科大学附属口腔医院正畸科,江苏 南京 210029,,南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室,南京医科大学附属口腔医院正畸科,江苏 南京 210029,,南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室,南京医科大学附属口腔医院正畸科,江苏 南京 210029,,南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室,南京医科大学附属口腔医院正畸科,江苏 南京 210029,

关键词:头颈部鳞状细胞癌;整合素α5;癌症基因组图谱

基金:国家自然科学基金(81571005);江苏省高等学校自然科学研究重大项目(17KJA320003);江苏省“333高层次人才培养工程”(BRA2016511);江苏省高校优势学科建设工程资助项目

目的:分析头颈部鳞状细胞癌中整合素α5(integrin α5,ITGA5)的表达与预后的相关性。方法:利用TCGA 数据库中头颈部鳞状细胞癌的RNA表达数据集和相应的临床随访信息,提取mRNA表达谱进行差异分析,并在GEO数据库中进一步验证。结果:通过TCGA表达谱数据分析发现ITGA5 mRNA在肿瘤组织中的表达明显高于正常组织,且Kaplan-Meier 分析显示ITGA5高表达组的患者总体存活时间明显缩短(P < 0.05)。在GEO数据库中验证后证实ITGA5 mRNA表达水平是1个独立的预后指标,对预测患者生存具有较好的敏感性和特异性。结论:ITGA5与头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后密切相关,可能作为新的预后标志物。

来源:2020年第6期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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