南京医科大学学报(自然科学版)

作者：史维俊，李欣灿，陆 飞，吴华彰，刘牧林

单位：蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科，安徽 蚌埠 233003,,蚌埠医学院第二附属医院全科医学科，安徽 蚌埠 233003,,蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科，安徽 蚌埠 233003,,蚌埠医学院生物医学系，安徽 蚌埠 233003,,蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科，安徽 蚌埠 233003,

关键词：MIR4713HG;生物信息学分析;结直肠癌;P53;进展;预后

基金：安徽省自然科学基金（1908085MH257）；安徽省教育厅科研基金（KJ2017A219）；蚌埠医学院科研创新团队及转化医学重点项目（BYKC201909，BYTM2019008）及研究生科研创新计划（Byycx1902）

目的：通过生物信息学方法，分析长链非编码RNA（long no-codding RNA，lncRNA）MIR4713HG对结直肠癌（colorectal cancer，CRC）进展及预后的作用，并进一步预测可能的分子机制。方法：从肿瘤基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库下载CRC基因表达数据及临床数据，应用Perl及R软件对数据进行整理后筛选出差异表达的基因；进一步对差异基因行生存、独立预后及临床病理相关性分析，选取相关性最强的差异基因作为目的基因；分析目的基因的表达与CRC不同临床病理特征的相关性及对患者预后的影响；利用R软件对不同的临床病理特征行独立预后分析；最后，对目的基因行基因集富集分析（gene set enrichment analysis，GSEA），并利用R软件分析目的基因与潜在靶基因的相关性，预测目的基因调控CRC进展及预后可能的机制。结果：通过对基因表达数据进行分析获得7 866个差异表达基因；对差异基因行生存、独立预后及临床病理特征相关性分析发现，MIR4713HG与CRC的生存预后及临床病理特征均显著相关。选取MIR4713HG作为目的基因，通过TCGA数据库发现MIR4713HG在CRC组织中显著高表达（P < 0.001）；MIR4713HG与CRC的分级、TNM分期具有相关性（P < 0.05），而与患者的年龄无相关性（P=0.999）；独立预后分析提示患者预后与MIR4713HG、年龄、肿瘤分级、TNM分期相关（P 0.25，P < 0.001）。结论：lncRNA MIR4713HG可作为评价CRC进展及预后的靶标，其可能通过P53/BAK1/FAS信号通路发挥作用。

来源：2020年第8期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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