南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2021年第2期:高通量测序技术检测非小细胞肺癌相关驱动基因的突变

发布日期:

作者:严晓娣,史国振,毛旭华

单位:南通大学附属医院肿瘤放疗科,江苏 南通 226001,,江苏大学附属宜兴医院心胸外科,江苏 无锡 214200,,江苏大学附属宜兴医院检验科,江苏 无锡 214200,

关键词:非小细胞肺癌;驱动基因突变;高通量测序;Sanger测序;微滴式数字PCR

基金:江苏大学临床医学科技发展基金(JLY2018 0004)

目的:探讨高通量测序技术在非小细胞肺癌驱动基因检测中的应用。方法:应用 Ion Torrent 高通量测序平台,检测150例非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)患者EGFR、KRAS、BRAF、NRAS、Her-2和PIK3CA基因突变,并利用Sanger 测序法和微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)法检测150例NSCLC患者EGFR基因突变,对结果进行对比分析。结果:EGFR、KRAS、BRAF、NRAS、Her-2和PIK3CA基因突变检出率分别为51.33%(77/150)、7.33%(11/150)、1.33%(2/150)、1.33%(2/150)、2.00%(3/150)和4.67%(7/150)。57例标本未检出任何基因突变,84例标本检出单个驱动基因发生突变。9例标本检出2个及以上驱动基因发生突变。Sanger测序法检测EGFR基因突变,突变检出率为38.67%(58/150),与高通量测序法比较,差异有统计学意义(χ2=4.862,P=0.027),高通量测序法的灵敏度为98.28%,特异度为78.26%。ddPCR法突变检出率为50.00%(75/150),与高通量测序法比较,差异无统计学意义(χ2=0.053,P=0.818),阳性一致率为82.67%,阴性一致率为80.00%,总一致率为81.33%。结论:高通量测序法更适合应用于NSCLC诊疗,Sanger测序法和ddPCR法可作为有益的补充。

来源:2021年第2期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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