南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2021年第3期:基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法

发布日期:

作者:周 春,吕 红,张若洋,陈 蓉,蔡 莉,刘太香,石宇鹏,洪 轲,刘成成,梁文飚

单位:江苏省血液中心,江苏 南京 210042,,江苏先声医学诊断有限公司,江苏 南京 210042,,江苏省血液中心,江苏 南京 210042,,江苏省血液中心,江苏 南京 210042,,江苏省血液中心,江苏 南京 210042,,江苏省血液中心,江苏 南京 210042,,江苏先声医学诊断有限公司,江苏 南京 210042,,江苏先声医学诊断有限公司,江苏 南京 210042,,江苏先声医学诊断有限公司,江苏 南京 210042,,江苏省血液中心,江苏 南京 210042,

关键词:MassARRAY;人血小板抗原;单核苷酸多态性;基因分型;质谱分析

基金:江苏省社会发展重点项目(BE2017757);江苏省卫生与计划生育委员会科技项目(H201514)

目的:建立基于MassARRAY质谱iPLEX分析技术的人血小板抗原(human platelet antigen,HPA)基因分型方法。方法:通过文献检索HPA1-29W系统的单核苷酸多态性突变或缺失位点的信息,确定35个目的基因突变位点,按MassARRAY突变位点标示方法、引物设计固定格式和引物设计软件在线设计90条引物(正、反向扩增引物和延伸引物各30条),以12个插入HPA1-29W野生型和突变型序列的合成质粒以及50例已知HPA分型的献血者样本进行扩增和质谱检测,分析灵敏度、特异度和重复性,随机抽取15例样本的一代测序和质谱分型结果进行对比验证,建立检测方法。结果:基于MassARRAY平台的HPA基因分型的质谱检测方法与测序法检测结果相符合,灵敏度为100%,特异度为100%,重复性为100%。结论:成功建立基于MassARRAY平台的HPA1-29W系统的质谱分型方法,适合中国人群HPA分型,具有临床应用前景。

来源:2021年第3期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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