南京医科大学学报(自然科学版)

作者：袁 逸，戴程婷，李一卉，王 莉，袁庆新

单位：南京医科大学第一附属医院内分泌科，江苏 南京 210029,,解放军东部战区总医院病理科，江苏 南京 210002,,中国人民解放军东部战区空军医院内分泌科，江苏 南京 210002,,南京医科大学第一附属医院内分泌科，江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院内分泌科，江苏 南京 210029,

关键词：IUGR;胰腺发育;转录组测序;LncRNA;糖尿病

基金：国家自然科学基金（81570697，81170715）

目的：通过全转录组测序比较宫内发育迟缓（intrauterine growth retardation，IUGR）新生鼠与正常新生鼠胰腺长链非编码RNA（long noncoding RNA，LncRNA）及信使RNA（messenger RNA，mRNA）表达谱的差别，探讨IUGR胰岛发育障碍及发生成年糖尿病的潜在机制。方法：建立IUGR新生鼠及正常新生鼠模型，对两种小鼠胰腺进行全转录组测序，分别对LncRNA和mRNA数据进行基因本体论（gene ontology，GO）分析，基于京都基因与基因组百科全书数据库（Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEEG）进行富集分析，全转录组数据联合分析后挑选与胰岛发育相关、表达差异高的LncRNA进行验证。结果：IUGR新生鼠和正常新生鼠差异表达LncRNA 294个，其中上调83个，下调211个；差异表达mRNA 2 000个，其中1 711个上调，289个下调。 LncRNA靶基因及差异mRNA的GO显示：生物学途径（biological process，BP）均集中于细胞过程、生物调节及代谢过程；细胞组件（cellular component，CC）集中在细胞及器官等过程；分子功能（molecular function，MF）集中于整合、催化活性、转运活性等。KEEG富集分析显示差异表达的LncRNA靶基因及mRNA主要集中于PI3K-Akt通路、MAPK通路及Foxo通路上。对差异表达LncRNA Snhg12、Rian的验证显示，它们在IUGR鼠与正常鼠中存在明显表达差异，与测序结果一致，且受糖浓度调节。结论：本研究分析并部分验证了IUGR差异表达的LncRNA和mRNA，有助于进一步探讨IUGR新生鼠胰岛发育障碍及发生成年糖尿病的潜在机制及LncRNA在其中的作用。

来源：2021年第6期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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