南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2022年第1期:利用CRISPR/Cas9技术高效构建巴马小型猪F9基因敲除细胞系

发布日期:

作者:朱晓晗,刘晓蕊,李 琳,王 盈,杨海元,戴一凡

单位:南京医科大学江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166,,南京医科大学江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166,,南京医科大学江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166,,南京医科大学江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166,,南京医科大学江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166,,南京医科大学江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166,

关键词:血友病乙;F9;CRISPR/Cas9;FⅨ

基金:国家自然科学基金(81970164,81874144)

目的:利用CRISP/Cas9基因编辑技术建立巴马小型猪F9基因敲除的胚胎成纤维(porcine fetal fibroblast,PFF)细胞系,为后续构建血友病乙巴马小型猪模型提供原材料。方法:首先通过生物信息学方法对人和猪F9基因同源性进行分析,模拟并分析人和猪FⅨ二级、三级结构的相似性;其次选取猪F9基因的第2外显子为敲除靶点,利用CRISPR在线靶点设计工具(http://www.e-crisp.org/E-CRISP/designcrispr.html)设计并合成单链向导 RNA(single guide RNA,sgRNA),以pX330质粒为骨架构建打靶载体,同G418抗性质粒一同转染至野生巴马小型猪的PFF中,经药物G418筛选获得抗性单细胞克隆,测序并鉴定其基因型。结果:生物信息学分析表明人和猪的F9基因具有较近的遗传距离,FⅨ的氨基酸序列相似值为83.33%,三维结构的均方根偏差(root mean square deviation,RMSD)值为0.149。成功构建打靶载体并转染PFF细胞,药筛后共获得55个单细胞克隆,经过测序显示有25个单细胞克隆的F9基因发生突变,计算敲除率为45.5%。结论:人和猪F9基因具有高度同源性;构建的Cas9/sgRNA 表达载体可以高效编辑PFF中的F9 基因。最终获取F9基因敲除的单细胞克隆,为构建乙型血友病巴马小型猪模型奠定了重要的前期工作基础。

来源:2022年第1期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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