南京医科大学学报(自然科学版)

作者：王莉，袁逸，唐艺，孙璐，袁庆新

单位：南京医科大学第一附属医院内分泌科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院内分泌科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院内分泌科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院内分泌科,江苏 南京 210029,,南京医科大学第一附属医院内分泌科,江苏 南京 210029,

关键词：宫内发育迟缓;lncRNA;mRNA;转录组测序;胰岛功能

基金：国家自然科学基金(81570697，81170715)

目的：对正常孕鼠和宫内发育迟缓(intrauterine growth retardation，IUGR)小鼠孕期胰岛RNA进行高通量测序分析， 筛选出差异表达的长链非编码RNA(long non⁃coding RNA，lncRNA)和信使RNA(messenger RNA，mRNA)，为深入探讨IUGR孕鼠胰岛功能障碍的发病机制提供理论基础。方法：提取IUGR成年后孕鼠和正常孕鼠胰岛RNA并进行高通量测序，筛选出差异表达的lncRNA和mRNA，进行lncRNA和mRNA关联分析，对lncRNA相关的靶mRNA进行GO功能注释分析、KEGG通路富集分析，重点关注高差异表达且可能影响孕期胰岛功能的lncRNA。结果：IUGR孕鼠和正常孕鼠差异表达的lncRNA 1 007个， 其中483个上调，524个下调；差异表达的mRNA 50个，其中22个上调，28个下调。对差异lncRNA的靶mRNA和差异mRNA进行功能分析，GO分析示它们参与的生物学途径集中于细胞及组织过程、生物调节、代谢及应激过程；分子功能集中在整合、催化活性、转运活性、分子功能调节等方面；KEGG分析示它们主要集中在代谢、癌症、次生代谢产物的生物合成、PI3K⁃AKT及 MAPK 通路。对差异表达的lncRNA FTX 和Neat1进一步分析表明，IUGR 孕鼠和正常孕鼠的FTX 表达量分别较未孕时下降 (P ＜ 0.001)，而 Neat1上升(P ＜ 0.01)；FTX、Neat1表达量在IUGR孕鼠和正常孕鼠间有显著差异(P ＜ 0.05)，且表达量受糖浓度调节。lncRNA FTX与其靶mRNA均为反式(trans)作用，lncRNA Neat1与Frmd8为顺式(cis)作用，余为trans作用。结论：本研究筛选出IUGR孕鼠和正常孕鼠胰岛中差异表达的lncRNA和mRNA，lncRNA通过不同互作关系调控靶mRNA，调节糖代谢过程。

来源：2022年第7期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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