南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2024年第3期:基于多序列MRI影像组学与深度迁移学习特征的脑胶质瘤分级预测研究

发布日期:

作者:刘志鹏,降建新,吴琪炜,周炎,卞雪峰,朱银杏

单位:南京医科大学附属泰州人民医院信息处,,神经外科,,影像科,江苏 泰州 225300,,南京医科大学附属泰州人民医院信息处,,影像科,江苏 泰州 225300,,南京医科大学泰州临床医学院,江苏 泰州 225300,

关键词:脑胶质瘤;磁共振成像;手工影像组学;深度迁移学习;深度学习影像组学;预测模型

基金:泰州市第五期“311工程”第二层次培养对象资助科研项目(RCPY202129);浦东新区科技发展基金事业单位民生科研专项(PKJ2021-Y09);泰州市中医药科技发展项目(TZ202301);南京医科大学附属泰州人民医院培育项目 (TZKY20220104);南京医科大学泰州临床医学院博士后科研资助项目(TZBSHKY202204)

目的:探讨基于多序列磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)手工影像组学(hand-crafted radiomic,HCR)和深度迁移学习(deep transfer learning,DTL)特征的机器学习(machine learning,ML)模型在术前预测脑胶质瘤分级的效能。方法:选取BraTS2019数据集中332例患者的影像数据[高级别胶质瘤(high-grade glioma,HGG)258例,低级别胶质瘤(low-grade glioma,LGG)74例],随机抽取30例HGG和8例LGG作为测试数据集,其余294例作为训练集和验证集。从T1、T2 、T1c和Flair 序列中提取病灶的HCR特征和DTL特征,并筛选出影响力前10的特征子集,基于HCR特征、DTL特征和两者组合的深度学习影像组学(deep learning radiomics,DLR)特征,分别建立7种ML模型,评估模型预测HGG和LGG的效能。选择最佳模型后,使用SHAP法对模型特征重要性进行量化及归因分析。结果:基于HCR和DTL组合的DLR特征构建的ML模型预测效能最高,当使用支持向量机的递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)筛选特征后,使用T2+T1c+ Flair序列组合的支持向量机(support vector machine,SVM)分类器的预测模型效果最佳。在验证集上,受试者工作特征曲线下面积达到0.996(95% CI:0.991~1.000),约登指数、准确度、灵敏度和特异度分别为 0.920、0.976、0.988和0.932,在测试集上同样具有较高的分级预测效能。SHAP特征权重分析显示Flair序列的特征贡献较大,其次为T2及T1c序列,HCR和DTL特征均有重要贡献。结论:基于多序列MRI的DLR特征构建的ML模型可有效预测脑胶质瘤的肿瘤分级,其中经过SVM-RFE筛选后的 T2+T1c+Flair序列组合的SVM分类器模型效能最佳。

来源:2024年第3期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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