南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2024年第9期:一种新型结直肠癌预后模型的建立与治疗预测

发布日期:

作者:张虎,毛春蓉,练云,庞洁,吴红雁,杜欣娜

单位:江苏医药职业学院基础医学部,江苏 盐城 224005,,江苏医药职业学院基础医学部,江苏 盐城 224005 ;东台市人民医院妇产科,江苏 盐城 224200,,江苏医药职业学院基础医学部,江苏 盐城 224005 ;东台市人民医院妇产科,江苏 盐城 224200,,江苏医药职业学院基础医学部,江苏 盐城 224005 ;东台市人民医院妇产科,江苏 盐城 224200,,江苏医药职业学院基础医学部,江苏 盐城 224005,,江苏医药职业学院基础医学部,江苏 盐城 224005,

关键词:结直肠癌;预后模型;LASSO-Cox回归;免疫治疗;化疗

基金:国家自然科学基金(82274339);江苏省青蓝工程项目(2021);江苏省产学研合作项目(FZ20210156);江苏省教育厅科研项目(22KJD310001);江苏省高校优秀科技创新团队(2023);江苏省心脑血管与癌症防控工程研究中心(2022);校企横向合作项目(2021320906000215、2021320906000004、2023320906000197);校级科研项目(20214401、20238316);盐城市工程中心建设项目(YC2022808)

目的:构建一种新的预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和治疗的模型。方法:利用单因素分析以及最小绝对收缩和选择运算(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)-Cox回归分析训练队列GSE39582,构建CRC预后标签(prognostic signature of colorectal cancer,PSCRC),并利用外部队列CRC_TCGA和GSE17536验证PSCRC。评估PSCRC与临床指标、肿瘤免疫微环境和免疫细胞浸润的相关性,基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)PSCRC的潜在功能。 整合PSCRC和临床分期等7个因素绘制预后列线图,并通过决策曲线分析(decision curve analysis,DCA)评估预后效果。最后, 预测免疫治疗和化疗疗效。结果:本研究构建了PSCRC,2个外部队列证实其预后灵敏度和特异度较高。TNM分期均显著影响PSCRC风险评分(P均< 0.001);PSCRC与肿瘤微环境基质评分、免疫评分和ESTIMATE评分均显著正相关(P均< 0.001),与中性粒细胞浸润显著正相关(P均< 0.05),与活化记忆性CD4+ T细胞浸润显著负相关(P均< 0.01)。进一步地GSEA分析显示, PSCRC可能参与氧化磷酸化、血管新生、缺氧和炎症应答等过程。重要的是,新构建模型显示出较好的预后能力,C指数为 0.765,95% 置信区间为0.747~0.783(P < 0.001)。最后,在3个队列中治疗预测均显示低风险评分组免疫治疗响应率更高(P均 < 0.001);PSCRC与伊马替尼、达沙替尼、帕唑帕尼等化疗药半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)显著负相关 (P均< 0.001),与二甲双胍、索拉非尼等药物IC50显著正相关(P均< 0.001)。结论:本研究构建了PSCRC,为CRC预后提供了良好的模型,还为预测治疗提供了潜在标志物。

来源:2024年第9期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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