南京医科大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST

国内刊号:32-1442/R

国际刊号:1007-4368

南京医科大学学报(自然科学版)杂志2025年第4期:基于16S核糖体RNA高通量测序前瞻性分析50岁及以上重度烧伤患者早期肠道菌群变化

发布日期:

作者:秦浩,谢卫国,陈小红,刘蒙,田霞

单位:武汉科技大学医学部医学院,湖北 武汉 430065 ;武汉大学同仁医院暨武汉市第三医院消化内科,,烧伤科,湖北 武汉 430000,,武汉大学同仁医院暨武汉市第三医院消化内科,,武汉大学同仁医院暨武汉市第三医院消化内科,,武汉大学同仁医院暨武汉市第三医院消化内科,

关键词:烧伤;肠道菌群;菌群多样性;高通量核苷酸测序

基金:国家自然科学基金(82100559);湖北省自然科学基金(2019CFB749)

目的:借助16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)高通量测序分析50岁及以上重度烧伤患者早期肠道菌群变化,为50岁及以上重度烧伤患者应用肠道菌群干预策略提供依据。方法:按照入排标准纳入13例重度烧伤患者(Burn 组)和同期12例健康志愿者(Control组)。收集两组临床资料及粪便样本,并对样本进行16S rRNA V4区基因测序,分析各类菌属的相对丰度;用Rarefy方法进行操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)划分,使用Z-score对差异菌群进行标准化,构建差异菌群热图,通过 QIIME 软件分析粪便菌群 OTU 数目及多样性指数;利用线性判别分析效应大小(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)解析优势菌群;通过PICRUSt2软件预测菌群功能丰度;使用R语言中的igraph包对试验样本属水平差异菌行相关性可视化分析。结果:重度烧伤患者早期肠道菌群以厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)为主。23种菌属在两组间的差异有统计学意义(P < 0.05)。差异菌群热图可见Control组的菌群丰度略优于Burn组。LEfSe分析表明,与 Control组相比,Burn组的肠道菌群物种数目在 1个门、2个纲、6个目、6个科和10个属中显著增加,两组差异微生物分布分支图提示Burn组以芽孢杆菌纲为主要区别标志菌群,Control组以梭菌纲为主要标志菌群。京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)功能预测分析提示两组间差异无统计学意义(P > 0.05)。联合网络可视化分析发现厚壁菌门影响最大,在可检测到的菌属中共有136对菌属彼此间具有一定的正相关或负相关性(|r|>0.3,P < 0.05),以协同作用为主。结论:50岁及以上重度烧伤患者早期肠道菌群与健康同龄人存在显著差异,有益菌种类及丰度减少,厌氧菌比例显著升高,不同菌群间存在一定的协同及拮抗作用。

来源:2025年第4期

《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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